PROGRAMME:
Mardi 27 Septembre
Matinée
​8h00 - 10h00
Introduction au data mining
​10h00 - 1030
Pause café
10h30 - 12h
Outils du data mining
​12h00 - 13h00
Déjeuner
Mardi 27 Septembre
Après midi
13h00 - 15h00
Initiation à R (Partie I)
​15h- 15h30
Pause café
​15h30- 17h30
Initiation à R (Partie II)
Mercredi 28 Septembre
Matinée
​08h00-10h00
Analyse de données pangénomiques avec PLINK (Genome Wide data analysis with Plink) (Partie I)
​10h00 - 1030
Pause café
​10h30-12h00
Analyse de données pangénomiques avec PLINK (Genome Wide data analysis with Plink) (Partie II)
Mercredi 28 Septembre
Après midi
​13h00 - 15h00
Analyse haplotypique ( Haploview, PHASE)
​15h - 15h30
Pause café
15h30 - 17h30
Annotation fonctionnelle
Jeudi 29 Septembre
Matinée
​08h00-10h00
Introduction aux plateformes de séquençage à haut débit
​10h00 - 1030
Pause café
​10h30-12h00
Exemple d’application 1 : Contrôle qualité et Alignement
​12h00- 13h00
Déjeuner
Jeudi 29 Septembre
Après midi
​13h00 - 15h00
Exemple d’application 2 : ’Variant calling’
​15h - 15h30
Pause café
15h30 - 17h30
Exemple d’application 3 : Annotation